コード例 #1
0
ファイル: diversity.py プロジェクト: ngannguyen/aimseqtk 
 def __init__(self, indir, outdir, indices, group2samples, matched,
              plotfmt=None, pval=1.0):
     Analysis.__init__(self, indir, outdir)
     self.indices = indices
     self.group2samples = group2samples
     self.matched = matched
     self.plotfmt = plotfmt
     self.pval = pval
コード例 #2
0
ファイル: clonesize.py プロジェクト: ngannguyen/aimseqtk 
 def __init__(self, indir, outdir, opts):
     Analysis.__init__(self, indir, outdir, opts)
コード例 #3
0
ファイル: trackclone.py プロジェクト: ngannguyen/aimseqtk 
 def __init__(self, indir, outdir, opts, clones):
     Analysis.__init__(self, indir, outdir, opts)
     self.clones = clones
コード例 #4
0
ファイル: overlap.py プロジェクト: ngannguyen/aimseqtk 
 def __init__(self, major_clones_dir, outdir, opts, c2n2s_dir):
     Analysis.__init__(self, major_clones_dir, outdir, opts)
     self.c2n2s_dir = c2n2s_dir