コード例 #1
0
ファイル: conftest.py プロジェクト: vallurumk/chanjo
def sambamba_exons(exon_lines):
    _exons = sambamba.depth_output(exon_lines)
    return _exons
コード例 #2
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ファイル: conftest.py プロジェクト: robinandeer/chanjo
def sambamba_exons(exon_lines):
    _exons = sambamba.depth_output(exon_lines)
    return _exons
コード例 #3
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def test_depth_output():
    exon_lines = ['# chrom chromStart chromEnd\n', '1 10 100\n']
    with pytest.raises(BedFormattingError):
        list(sambamba.depth_output(exon_lines))