Exemplo n.º 1
0
def sambamba_exons(exon_lines):
    _exons = sambamba.depth_output(exon_lines)
    return _exons
Exemplo n.º 2
0
def sambamba_exons(exon_lines):
    _exons = sambamba.depth_output(exon_lines)
    return _exons
Exemplo n.º 3
0
def test_depth_output():
    exon_lines = ['# chrom chromStart chromEnd\n', '1 10 100\n']
    with pytest.raises(BedFormattingError):
        list(sambamba.depth_output(exon_lines))