Python get_cname_mapの例

コード例 #1

ファイル: test_munge_sumstats.py プロジェクト: zhanyq/mtag

 def test_ignore(self):
     ignore = ['sNp', 'a1']
     flag_cnames = {'SNP': 'SNP', 'ASDF': 'ASDF', 'N': 'FOOBAR'}
     x = munge.get_cname_map(flag_cnames, munge.default_cnames, ignore)
     # check that ignore columns are ignored
     nose.tools.assert_raises(KeyError, x.__getitem__, 'SNP')
     nose.tools.assert_raises(KeyError, x.__getitem__, 'A1')
     # check that flag columns make it into the dict
     self.assertEqual(x['ASDF'], 'ASDF')
     # check that default columns make it into the dict
     self.assertEqual(x['A2'], 'A2')
     # check that flags override default
     self.assertEqual(x['N'], 'FOOBAR')

コード例 #2

ファイル: test_munge_sumstats.py プロジェクト: Chris1221/ldsc

 def test_ignore(self):
     ignore = ['sNp', 'a1']
     flag_cnames = {'SNP': 'SNP', 'ASDF': 'ASDF', 'N': 'FOOBAR'}
     x = munge.get_cname_map(flag_cnames, munge.default_cnames, ignore)
     # check that ignore columns are ignored
     nose.tools.assert_raises(KeyError, x.__getitem__, 'SNP')
     nose.tools.assert_raises(KeyError, x.__getitem__, 'A1')
     # check that flag columns make it into the dict
     self.assertEqual(x['ASDF'], 'ASDF')
     # check that default columns make it into the dict
     self.assertEqual(x['A2'], 'A2')
     # check that flags override default
     self.assertEqual(x['N'], 'FOOBAR')

コード例 #3

ファイル: test_munge_sumstats.py プロジェクト: zhanyq/mtag

 def test_no_flags(self):
     x = munge.get_cname_map({}, munge.default_cnames, [])
     self.assertEqual(x, munge.default_cnames)

コード例 #4

ファイル: test_munge_sumstats.py プロジェクト: Chris1221/ldsc

 def test_no_flags(self):
     x = munge.get_cname_map({}, munge.default_cnames, [])
     self.assertEqual(x, munge.default_cnames)