Python DownloadWorkflow.outdirの例

コード例 #1

ファイル: test_download.py プロジェクト: jfy133/tools

 def test_download_configs(self, outdir):
     download_obj = DownloadWorkflow(pipeline="nf-core/methylseq",
                                     revision="1.6")
     download_obj.outdir = outdir
     download_obj.download_configs()
     assert os.path.exists(
         os.path.join(outdir, "configs", "nfcore_custom.config"))

コード例 #2

ファイル: test_download.py プロジェクト: adomingues/tools

 def test_download_configs(self):
     outdir = tempfile.mkdtemp()
     download_obj = DownloadWorkflow(pipeline="nf-core/methylseq",
                                     release="1.6")
     download_obj.outdir = outdir
     download_obj.download_configs()
     assert os.path.exists(
         os.path.join(outdir, "configs", "nfcore_custom.config"))

コード例 #3

ファイル: test_download.py プロジェクト: jfy133/tools

 def test_download_wf_files(self, outdir):
     download_obj = DownloadWorkflow(pipeline="nf-core/methylseq",
                                     revision="1.6")
     download_obj.outdir = outdir
     download_obj.wf_sha = "b3e5e3b95aaf01d98391a62a10a3990c0a4de395"
     download_obj.wf_download_url = (
         "https://github.com/nf-core/methylseq/archive/b3e5e3b95aaf01d98391a62a10a3990c0a4de395.zip"
     )
     download_obj.download_wf_files()
     assert os.path.exists(os.path.join(outdir, "workflow", "main.nf"))