Python runの例

コード例 #1

ファイル: roi_details.py プロジェクト: vbharadwaj-bk/diBELLA.2D

def main():
    parser = argparse.ArgumentParser(description='Plot ROI file.')
    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = DetailedRoiGenerator(args)
    return app.run()

コード例 #2

ファイル: roi_details.py プロジェクト: IsmailM/seqan

def main():
    parser = argparse.ArgumentParser(description='Plot ROI file.')
    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = DetailedRoiGenerator(args)
    return app.run()

コード例 #3

def main():
    """Program entry point."""
    parser = argparse.ArgumentParser(description='Plot ROI file.')
    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = PlotThumbnailsApp(args)
    return app.run()

コード例 #4

ファイル: roi_plot_thumbnails.py プロジェクト: qPCR4vir/seqan

def main():
    """Program entry point."""
    parser = argparse.ArgumentParser(description="Plot ROI file.")
    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = PlotThumbnailsApp(args)
    return app.run()

コード例 #5

ファイル: roi_table.py プロジェクト: CVroland/seqan

def main():
    parser = argparse.ArgumentParser(description='Plot ROI file.')

    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser, default_plot_height=60,
                                          default_plot_width=90)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = TableApp(args)
    return app.run()

コード例 #6

def main():
    parser = argparse.ArgumentParser(description='Plot ROI file.')

    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser, default_plot_height=60,
                                          default_plot_width=90)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = TableApp(args)
    return app.run()