Exemplos de run em Python

Exemplo n.º 1

Arquivo: roi_details.py Projeto: vbharadwaj-bk/diBELLA.2D

def main():
    parser = argparse.ArgumentParser(description='Plot ROI file.')
    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = DetailedRoiGenerator(args)
    return app.run()

Exemplo n.º 2

Arquivo: roi_details.py Projeto: IsmailM/seqan

def main():
    parser = argparse.ArgumentParser(description='Plot ROI file.')
    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = DetailedRoiGenerator(args)
    return app.run()

Exemplo n.º 3

def main():
    """Program entry point."""
    parser = argparse.ArgumentParser(description='Plot ROI file.')
    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = PlotThumbnailsApp(args)
    return app.run()

Exemplo n.º 4

Arquivo: roi_plot_thumbnails.py Projeto: qPCR4vir/seqan

def main():
    """Program entry point."""
    parser = argparse.ArgumentParser(description="Plot ROI file.")
    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = PlotThumbnailsApp(args)
    return app.run()

Exemplo n.º 5

Arquivo: roi_table.py Projeto: CVroland/seqan

def main():
    parser = argparse.ArgumentParser(description='Plot ROI file.')

    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser, default_plot_height=60,
                                          default_plot_width=90)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = TableApp(args)
    return app.run()

Exemplo n.º 6

def main():
    parser = argparse.ArgumentParser(description='Plot ROI file.')

    ngs_roi.argparse.addFileArguments(parser)
    ngs_roi.argparse.addPlotGridArguments(parser, default_plot_height=60,
                                          default_plot_width=90)
    ngs_roi.argparse.addLinkArguments(parser)
    args = parser.parse_args()
    ngs_roi.argparse.applyFileDefaults(args)

    app = TableApp(args)
    return app.run()