コード例 #1
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ファイル: hdf5.py プロジェクト: pmc-tables/pmc-tables
def read_hdf5_metadata(key: str, store: pd.HDFStore) -> dict:
    node = store.get_node(key)
    metadata = {}
    for attr_key in set(
            node._v_attrs.__dict__.keys()) - set(_RESERVED_ATTRIBUTES):
        metadata[attr_key] = node._f_getattr(attr_key)
    return metadata
コード例 #2
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 def get_children_paths(self, node_path):
     s = HDFStore(self.path)
     node = s.get_node(node_path)
     children = []
     for child, df in node._v_children.items():
         children.append(df._v_pathname)
     s.close()
     return children
コード例 #3
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 def get_children_paths(self, node_path):
     s = HDFStore(self.path)
     node = s.get_node(node_path)
     children = []
     for child, df in node._v_children.items():
         children.append(df._v_pathname)
     s.close()
     return children
コード例 #4
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ファイル: hdf5.py プロジェクト: pmc-tables/pmc-tables
def _get_or_create_node(key: str, store: pd.HDFStore) -> tables.Node:
    node = None
    # Get the node
    try:
        node = store.get_node(key)
    except tables.exceptions.NoSuchNodeError as e:
        logger.warning("Got error: %s", e)
    # Create the node
    if node is None:
        if not key.startswith('/'):
            key = '/' + key
        node = _create_node(key, store)
    assert node is not None
    return node
コード例 #5
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ファイル: helper.py プロジェクト: xmduhan/contest
def removeDataFrame(dfName):
    dbName = 'db.h5'
    s = HDFStore(dbName)
    if s.get_node(dfName):
        s.remove(dfName)
    s.close()