예제 #1
0
def run(input_dir, output_dir, config_dir, debug: bool):
    setup_logging(debug)
    csr2transmart(
        input_dir,
        output_dir,
        config_dir,
        'CSR',
        '\\Central Subject Registry\\',
    )
예제 #2
0
def run(input_dir, ngs_dir, output_dir, debug: bool):
    setup_logging(debug)
    csr2cbioportal(input_dir, ngs_dir, output_dir)
예제 #3
0
def run(input_dir, output_dir, config_dir, debug: bool):
    setup_logging(debug)
    sources2csr(input_dir, output_dir, config_dir)