def setUp(self):
"""Tworzenie instancji dla klascy SequenceFinder"""
self.program = SequenceFinder()
self.program.input_file_a = "test_file.txt"
# self.program.entry = ["pozycja", "nukleotyd"]
# self.program.positions = ["brak"] + range(1, 26)
# self.program.nukleotydy = ["brak", "A", "G", "C", "T", "U"]
self.program.open_input_file(self.program.input_file_a)
self.program.position1 = ttk.Combobox()
self.program.position2 = ttk.Combobox()
self.program.position3 = ttk.Combobox()
self.program.nukleotyd1 = ttk.Combobox()
self.program.nukleotyd2 = ttk.Combobox()
self.program.nukleotyd3 = ttk.Combobox()
class MicroRNA_Sequence_Filter_Test(unittest.TestCase):
"""Tests for MicroRNA_Sequence_Filter2.py"""
def setUp(self):
"""Tworzenie instancji dla klascy SequenceFinder"""
self.program = SequenceFinder()
self.program.input_file_a = "test_file.txt"
# self.program.entry = ["pozycja", "nukleotyd"]
# self.program.positions = ["brak"] + range(1, 26)
# self.program.nukleotydy = ["brak", "A", "G", "C", "T", "U"]
self.program.open_input_file(self.program.input_file_a)
self.program.position1 = ttk.Combobox()
self.program.position2 = ttk.Combobox()
self.program.position3 = ttk.Combobox()
self.program.nukleotyd1 = ttk.Combobox()
self.program.nukleotyd2 = ttk.Combobox()
self.program.nukleotyd3 = ttk.Combobox()
def test_start_SequenceFinder(self):
"""Testy parametrów uruchamiania programu"""
self.assertEqual(self.program.entry, ["pozycja", "nukleotyd"])
self.assertEqual(self.program.positions, ["brak"] + range(1, 26))
self.assertEqual(self.program.nukleotydy, ["brak", "A", "G", "C", "T", "U"])
def test_input_control(self):
""" Testowanie danych input, parametrów przeszukiwania sekwencji."""
self.program.position1.insert(0, self.program.entry[0])
self.program.position2.insert(0, self.program.positions[0])
self.program.position3.insert(0, 3)
self.program.nukleotyd1.insert(0, self.program.entry[1])
self.program.nukleotyd2.insert(0, self.program.nukleotydy[0])
self.program.nukleotyd3.insert(0, "U")
self.program.input_control()
self.assertEquals(self.program.pos1, False,
msg="test_input_control - {}".format(self.program.pos1))
self.assertEquals(self.program.nuc1, False,
msg="test_input_control - {}".format(self.program.nuc1))
self.assertEquals(self.program.pos2, False,
msg="test_input_control - {}".format(self.program.pos2))
self.assertEquals(self.program.nuc2, False,
msg="test_input_control - {}".format(self.program.nuc2))
self.assertEquals(self.program.pos3, "3",
msg="test_input_control - {}".format(self.program.pos3))
self.assertEquals(self.program.nuc3, "U",
msg="test_input_control - {}".format(self.program.nuc3))
def test_get_pos_from_str(self):
"""Test get_pos_from_str - testuje czy pozycja nukleotydu jest int i ma włąściwą wartość"""
for x in self.program.positions[1:]:
for y in self.program.positions[1:]:
for z in self.program.positions[1:]:
self.program.pos1, self.program.pos2, self.program.pos3 = x, y, z
self.program.get_pos_from_str()
self.assertEquals(self.program.pos1, int(x)-1,
msg="test_get_pos_from_str - {}-->{}".format(self.program.pos1, x-1))
self.assertEquals(self.program.pos2, int(y)-1,
msg="test_get_pos_from_str - {}-->{}".format(self.program.pos2, y-1))
self.assertEquals(self.program.pos3, int(z)-1,
msg="test_get_pos_from_str - {}-->{}".format(self.program.pos3, z-1))
def test_check_brak_seq(self):
""" Test sprawdzający brak wyników wyszukiwania"""
self.program.output_seq = ""
self.program.check_brak_seq()
self.assertEqual(self.program.output_seq, "\nBrak sekwencji spełniających zadane warunki",
msg="Sprawdź --> test_check_brak_seq")
def test_selekcja_sekwencji(self):
"""Test wyszukiwania sekwencji wedłóg zadanych parametrów dla i nukleotydu"""
# Testowanie tylko prawidłowych danych dla self.program.pos i self.program.nuc
# Przypadki z danymi nieprawidłowymi ("pozycja", "nukleotyd", "brak")
# sprawdzane są w poprzednich testach
self.program.selekcja_sekwencji_1(0, "A")
self.assertEqual(self.program.output_seq, expected_output_selekcja_1,
msg="Sprawdź --> test_selekcja_sekwencji_1")
self.program.open_input_file(self.program.input_file_a)
self.program.selekcja_sekwencji_2(0, "A", 1, "U")
self.assertEqual(self.program.output_seq, expected_output_selekcja_2,
msg="Sprawdź --> test_selekcja_sekwencji_2")
self.program.open_input_file(self.program.input_file_a)
self.program.selekcja_sekwencji_3(0, "A", 1, "U", 2, "G")
self.assertEqual(self.program.output_seq, expected_output_selekcja_3,
msg="Sprawdź --> test_selekcja_sekwencji_3")
def test_go(self):
"""Test wyszukiwania sekwencji w przypadku fałaszywych danych wyszukiwania."""
self.program.position1['values'] = "pozycja"
self.program.position2['values'] = "pozycja"
self.program.position3['values'] = "pozycja"
self.program.nukleotyd1['values'] = "nukleotyd"
self.program.nukleotyd2['values'] = "nukleotyd"
self.program.nukleotyd3['values'] = "nukleotyd"
self.program.text_field = Tkinter.Text()
self.program.go()
self.assertEqual(self.program.output_seq, "brak sekwencji spełniających zadane warunki")
