def setUp(self): """Tworzenie instancji dla klascy SequenceFinder""" self.program = SequenceFinder() self.program.input_file_a = "test_file.txt" # self.program.entry = ["pozycja", "nukleotyd"] # self.program.positions = ["brak"] + range(1, 26) # self.program.nukleotydy = ["brak", "A", "G", "C", "T", "U"] self.program.open_input_file(self.program.input_file_a) self.program.position1 = ttk.Combobox() self.program.position2 = ttk.Combobox() self.program.position3 = ttk.Combobox() self.program.nukleotyd1 = ttk.Combobox() self.program.nukleotyd2 = ttk.Combobox() self.program.nukleotyd3 = ttk.Combobox()
class MicroRNA_Sequence_Filter_Test(unittest.TestCase): """Tests for MicroRNA_Sequence_Filter2.py""" def setUp(self): """Tworzenie instancji dla klascy SequenceFinder""" self.program = SequenceFinder() self.program.input_file_a = "test_file.txt" # self.program.entry = ["pozycja", "nukleotyd"] # self.program.positions = ["brak"] + range(1, 26) # self.program.nukleotydy = ["brak", "A", "G", "C", "T", "U"] self.program.open_input_file(self.program.input_file_a) self.program.position1 = ttk.Combobox() self.program.position2 = ttk.Combobox() self.program.position3 = ttk.Combobox() self.program.nukleotyd1 = ttk.Combobox() self.program.nukleotyd2 = ttk.Combobox() self.program.nukleotyd3 = ttk.Combobox() def test_start_SequenceFinder(self): """Testy parametrów uruchamiania programu""" self.assertEqual(self.program.entry, ["pozycja", "nukleotyd"]) self.assertEqual(self.program.positions, ["brak"] + range(1, 26)) self.assertEqual(self.program.nukleotydy, ["brak", "A", "G", "C", "T", "U"]) def test_input_control(self): """ Testowanie danych input, parametrów przeszukiwania sekwencji.""" self.program.position1.insert(0, self.program.entry[0]) self.program.position2.insert(0, self.program.positions[0]) self.program.position3.insert(0, 3) self.program.nukleotyd1.insert(0, self.program.entry[1]) self.program.nukleotyd2.insert(0, self.program.nukleotydy[0]) self.program.nukleotyd3.insert(0, "U") self.program.input_control() self.assertEquals(self.program.pos1, False, msg="test_input_control - {}".format(self.program.pos1)) self.assertEquals(self.program.nuc1, False, msg="test_input_control - {}".format(self.program.nuc1)) self.assertEquals(self.program.pos2, False, msg="test_input_control - {}".format(self.program.pos2)) self.assertEquals(self.program.nuc2, False, msg="test_input_control - {}".format(self.program.nuc2)) self.assertEquals(self.program.pos3, "3", msg="test_input_control - {}".format(self.program.pos3)) self.assertEquals(self.program.nuc3, "U", msg="test_input_control - {}".format(self.program.nuc3)) def test_get_pos_from_str(self): """Test get_pos_from_str - testuje czy pozycja nukleotydu jest int i ma włąściwą wartość""" for x in self.program.positions[1:]: for y in self.program.positions[1:]: for z in self.program.positions[1:]: self.program.pos1, self.program.pos2, self.program.pos3 = x, y, z self.program.get_pos_from_str() self.assertEquals(self.program.pos1, int(x)-1, msg="test_get_pos_from_str - {}-->{}".format(self.program.pos1, x-1)) self.assertEquals(self.program.pos2, int(y)-1, msg="test_get_pos_from_str - {}-->{}".format(self.program.pos2, y-1)) self.assertEquals(self.program.pos3, int(z)-1, msg="test_get_pos_from_str - {}-->{}".format(self.program.pos3, z-1)) def test_check_brak_seq(self): """ Test sprawdzający brak wyników wyszukiwania""" self.program.output_seq = "" self.program.check_brak_seq() self.assertEqual(self.program.output_seq, "\nBrak sekwencji spełniających zadane warunki", msg="Sprawdź --> test_check_brak_seq") def test_selekcja_sekwencji(self): """Test wyszukiwania sekwencji wedłóg zadanych parametrów dla i nukleotydu""" # Testowanie tylko prawidłowych danych dla self.program.pos i self.program.nuc # Przypadki z danymi nieprawidłowymi ("pozycja", "nukleotyd", "brak") # sprawdzane są w poprzednich testach self.program.selekcja_sekwencji_1(0, "A") self.assertEqual(self.program.output_seq, expected_output_selekcja_1, msg="Sprawdź --> test_selekcja_sekwencji_1") self.program.open_input_file(self.program.input_file_a) self.program.selekcja_sekwencji_2(0, "A", 1, "U") self.assertEqual(self.program.output_seq, expected_output_selekcja_2, msg="Sprawdź --> test_selekcja_sekwencji_2") self.program.open_input_file(self.program.input_file_a) self.program.selekcja_sekwencji_3(0, "A", 1, "U", 2, "G") self.assertEqual(self.program.output_seq, expected_output_selekcja_3, msg="Sprawdź --> test_selekcja_sekwencji_3") def test_go(self): """Test wyszukiwania sekwencji w przypadku fałaszywych danych wyszukiwania.""" self.program.position1['values'] = "pozycja" self.program.position2['values'] = "pozycja" self.program.position3['values'] = "pozycja" self.program.nukleotyd1['values'] = "nukleotyd" self.program.nukleotyd2['values'] = "nukleotyd" self.program.nukleotyd3['values'] = "nukleotyd" self.program.text_field = Tkinter.Text() self.program.go() self.assertEqual(self.program.output_seq, "brak sekwencji spełniających zadane warunki")