from __future__ import print_function
import os
import unittest
from molbiox.algor.translate import CodonTable
from molbiox.frame.signature import Sig
from molbiox.frame.regexon import Regexon
from molbiox.kb.translate import get_transl_table
sub = Regexon.new(r'[^a-zA-Z]', '')
test_data = {
'dna': """
TTGATGGCTAAGAGTAAAATCTTAAAAAACACACTGGTTCTATATTTTCGTCAAGTTTTG
ATTGTATTAATTACTCTCTATTCAATGAGAGTTGTATTAAATGAATTAGGTGTGGATGAT
TTTGGTATTTATAGCGTTGTGGCTGGTTTTGTAACTTTACTTGCATTTTTACCCGGAAGC
ATGGCGAGTGCAACGCAGCGGTTTTTCTCTTTTGCGATGGGGAAATCGGATATAGTAAAA
TTAAAGCAAACCTTCAGTGTTAATTTAGTTATGTATACTGGCATAGCCTTGTTAGCATAT
ATAACATTTCAAACTATCGGATTTTGGTATGTTGATGAATATCTAAAAATACCTCATAAC
CGCTTTCATGCAGCCTTGGAATTATATCACTATGTGTCTTTATCATTTATTTTTTCAATT
TTTTCTGCGCCTTTTATCGCGATTTTAATTGCGCACGAAGATATGCACATTTATGCGATC
TTCTCGGTTTTTGATGCATTTTTAAAACTAGTAGCCGCAATTTCTTTAGACTATGTGAAC
TATGATTTGTTAGCTTATTATGGAGTGGCTCTTTTGATTGTATCTGGATTGCTTGCTTTC
GCGTATATTTTTATATGTATAAAGAAATATCCAGAGTGTCAAATGAAAAAGCTTTATTGG
AGTTCGAGTATACTGAAAGAAATTATTGGTTTCACGATATGGACTTTGCTAGGTCAATTG
AGCACTGTTTTTAGAAATCAGGCAGTAACTGTTCTTGTAAACCAAATGTTTAATCCTTCA
ATTGTGGCAGCTCGTGCAATTGCCTTGAATGTGGCTAGTCAAGTTGGAATTTTTTCGAAT
AATTTAAATACAGGGTTATATCCACCAATTATAAAAGCTTACGCAGCAAATCAAAAAGAG
GAAATGCTGAGTTTAGTTTTTAATGGTTCTAAACTGACTTTCTTCTTGATGTGGGTATGT
GCATTACCCATGTTGCTTGAAATGGAAACGATATTAACACTTTGGCTAAAAACACCACCA
TCAGAAGCGATATTATTTACTCAGTTAGCGATTGTTGAATCCTTGATACTGGCTATAAGC
