Exemplos de is_cram em Python

Exemplo n.º 1

def sniffer(filename):

    try:
        if is_sam(filename): return "SAM"
    except:
        pass

    try:
        if is_bam(filename): return "BAM"
    except:
        pass

    try:
        if is_cram(filename): return "CRAM"
    except:
        pass

    try:
        if is_fastq(filename): return "FASTQ"
    except:
        pass

    try:
        if is_fasta(filename): return "FASTA"
    except:
        pass

Exemplo n.º 2

Arquivo: sniffer.py Projeto: sequana/sequana

def sniffer(filename):

    try:
        if is_sam(filename): return "SAM"
    except:
        pass

    try:
        if is_bam(filename): return "BAM"
    except:
        pass

    try:
        if is_cram(filename): return "CRAM"
    except:
        pass

    try:
        if is_fastq(filename): return "FASTQ"
    except:
        pass

    try:
        if is_fasta(filename): return "FASTA"
    except:
        pass

Exemplo n.º 3

Arquivo: test_bamtools.py Projeto: sequana/sequana

def test_is_cram():
    datatest = sequana_data("test_measles.cram", "testing")
    assert is_cram(datatest) is True

Exemplo n.º 4

def test_is_cram():
    datatest = sequana_data("test_measles.cram", "testing")
    assert is_cram(datatest) is True