Exemplos de _fastq_sniffer em Python

Exemplo n.º 1

Arquivo: test_fastq.py Projeto: hainm/scikit-bio

 def test_negatives(self):
     for fp in self.negatives:
         self.assertEqual(_fastq_sniffer(fp), (False, {}))

Exemplo n.º 2

Arquivo: test_fastq.py Projeto: hainm/scikit-bio

 def test_positives(self):
     for fp in self.positives:
         self.assertEqual(_fastq_sniffer(fp), (True, {}))

Exemplo n.º 3

 def test_negatives(self):
     for fp in self.negatives:
         self.assertEqual(_fastq_sniffer(fp), (False, {}))

Exemplo n.º 4

 def test_illumina_sniffed(self):
     fp = get_data_path('fastq_single_seq_illumina1.8')
     self.assertEqual(_fastq_sniffer(fp), (True, {'variant':
                                                  'illumina1.8'}))

Exemplo n.º 5

 def test_positives(self):
     for fp in self.positives:
         self.assertEqual(_fastq_sniffer(fp), (True, {}))