Python gene_size_dict示例

示例#1

文件： random_noncoding_seq_test.py 项目： gturco/random_bio_tools

 def setUp(self):
     self.tab_file = '/Users/gturco/Desktop/rice_set_size.tsv'
     self.size_dict = gene_size_dict(self.tab_file)
     self.bed_file = '/Users/gturco/data/paper3/rice_b_set.nolocaldups.with_new_cns_mask.bed'

示例#2

文件： random_noncoding_seq_test.py 项目： gturco/random_bio_tools

 def test_dict(self):
     size_dict = gene_size_dict(self.tab_file)
     print size_dict["Os01g02200"]
     self.assertEqual(len(size_dict["Os01g02200"]), 13)