Ejemplos de GeneProf.search_genes en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_geneprof.py Proyecto: schryer/bioservices

def test_1():
    g = GeneProf(verbose=False)
    g.get_list_reference_datasets()

    g.get_list_experiment_samples("mouse")
    g.get_list_experiment_samples("human", frmt="txt")
    g.get_list_experiment_samples("human", frmt="rdata")

    g.search_genes("sox2")
    g.search_genes("sox2", taxons="9606")
    g.search_genes("sox2", taxons="9606, 10090")
    res = g.search_genes("brca2 AND cancer AND reference", taxons="mouse")

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_geneprof.py Proyecto: cxhernandez/bioservices

def test_1():
    g = GeneProf(verbose=False)
    g.get_list_reference_datasets()

    g.get_list_experiment_samples("mouse")
    g.get_list_experiment_samples("human", frmt="txt")
    g.get_list_experiment_samples("human", frmt="rdata")

    g.search_genes("sox2")
    g.search_genes("sox2", taxons="9606")
    g.search_genes("sox2", taxons="9606, 10090")
    res = g.search_genes("brca2 AND cancer AND reference", taxons="mouse")