Ejemplos de get_three_prime_utr_length en Python

Lenguaje de programación: Python

Namespace/Package Name: immuno.ensembl.annotation

Método / Función: get_three_prime_utr_length

Ejemplos en hotexamples.com: 3

Python get_three_prime_utr_length - 3 ejemplos encontrados. Estos son los ejemplos en Python del mundo real mejor valorados de immuno.ensembl.annotation.get_three_prime_utr_length extraídos de proyectos de código abierto. Puedes valorar ejemplos para ayudarnos a mejorar la calidad de los ejemplos.

Ejemplo n.º 1

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Archivo: test_ensembl.py Proyecto: xflicsu/immuno

def test_get_3prime_utr_length_CTNNB1():

    transcript_id = "ENST00000405570"
    exons = ensembl.get_exons_from_transcript(transcript_id)

    utr_length = ensembl.get_three_prime_utr_length(exons)
    print utr_length
    assert(utr_length == 11)

Ejemplo n.º 2

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Archivo: test_ensembl.py Proyecto: xflicsu/immuno

def test_get_3prime_utr_length_reverse_strand_CASP9():

    transcript_id = "ENST00000333868"
    exons = ensembl.get_exons_from_transcript(transcript_id)

    utr_length = ensembl.get_three_prime_utr_length(exons, forward = False)
    print utr_length
    assert(utr_length == 673)

Ejemplo n.º 3

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Archivo: test_ensembl.py Proyecto: xflicsu/immuno

def test_get_3prime_utr_length_RET():

    transcript_id = "ENST00000355710"
    exons = ensembl.get_exons_from_transcript(transcript_id)

    utr_length = ensembl.get_three_prime_utr_length(exons)
    print utr_length
    assert(utr_length == 2082)