Ejemplo n.º 1
0
 def testMapSplicedRead4(self):
     self.assertEqual(hw.mapSplicedRead("GTGGCCGGTAAACATAGATGTCTGGGGAACTTACCCTAAC", reads.lacDNA, 15), [417, 437, 9042, 9062] )
Ejemplo n.º 2
0
 def testMapSplicedRead2(self):
     self.assertEqual(hw.mapSplicedRead("AACC", "GGAAGGCC",2), [2, 4, 6, 8])
Ejemplo n.º 3
0
 def testMapSplicedRead3(self):
     self.assertEqual(hw.mapSplicedRead("CCAA", "GGAAGGCC",2), 'NOT FOUND')
Ejemplo n.º 4
0
 def testMapSplicedRead1(self):
     self.assertEqual(hw.mapSplicedRead("ATT", "ATAT", 3), 'NOT FOUND')
Ejemplo n.º 5
0
 def testMapSplicedRead4(self):
     self.assertEqual(
         hw.mapSplicedRead("GTGGCCGGTAAACATAGATGTCTGGGGAACTTACCCTAAC",
                           reads.lacDNA, 15), [417, 437, 9042, 9062])
Ejemplo n.º 6
0
 def testMapSplicedRead3(self):
     self.assertEqual(hw.mapSplicedRead("CCAA", "GGAAGGCC", 2), 'NOT FOUND')
Ejemplo n.º 7
0
 def testMapSplicedRead2(self):
     self.assertEqual(hw.mapSplicedRead("AACC", "GGAAGGCC", 2),
                      [2, 4, 6, 8])
Ejemplo n.º 8
0
 def testMapSplicedRead1(self):
     self.assertEqual(hw.mapSplicedRead("ATT", "ATAT", 3), 'NOT FOUND')