Ejemplos de load_prots_from_fasta en Python

Lenguaje de programación: Python

Namespace/Package Name: seqs

Método / Función: load_prots_from_fasta

Ejemplos en hotexamples.com: 2

Python load_prots_from_fasta - 2 ejemplos encontrados. Estos son los ejemplos en Python del mundo real mejor valorados de seqs.load_prots_from_fasta extraídos de proyectos de código abierto. Puedes valorar ejemplos para ayudarnos a mejorar la calidad de los ejemplos.

Ejemplo n.º 1

Mostrar archivo

Archivo: corum.py Proyecto: marcottelab/infer_complexes

def load_havug_cxs(convert_ensg=True):
    fname = ut.proj_path('havug_cxs')
    u2e = ut.dict_inverse_sets(ut.load_dict_sets(
        '../../data/convert/Hs2Hs_uni.tab'))
    hcxs = ut.load_list_of_type(fname,set)
    if convert_ensg:
        hcxs = convert_complexes([(i,c) for i,c in
            enumerate(hcxs)], u2e,
            seqs.load_prots_from_fasta('../../data/sequences/canon/Hs.fasta'))
    return hcxs

Ejemplo n.º 2

Mostrar archivo

Archivo: count_orthologs.py Proyecto: marcottelab/infer_complexes

def all_genes(sp):
    ps = seqs.load_prots_from_fasta('../../data/sequences/canon/%s.fasta' % sp)
    return ps