Esempi in Python per get_color

Esempio n. 1

    def test_color(self):
        self.color.method = COLOR_COLOR
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_COLOR)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'color': 1})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ColorID 1')

        self.color.set_parameters(color=3)
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_COLOR)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'color': 3})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ColorID 3')

Esempio n. 2

    def test_volume(self):
        self.color.method = COLOR_VOLUME
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VOLUME)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'volume_id': 0})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Volume 0')

        self.color.set_parameters(volume_id=42)
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VOLUME)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'volume_id': 42})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Volume 42')

Esempio n. 3

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

    def test_volume(self):
        self.color.method = COLOR_VOLUME
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VOLUME)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'volume_id': 0})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Volume 0')

        self.color.set_parameters(volume_id=42)
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VOLUME)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'volume_id': 42})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Volume 42')

Esempio n. 4

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

    def test_color(self):
        self.color.method = COLOR_COLOR
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_COLOR)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'color': 1})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ColorID 1')

        self.color.set_parameters(color=3)
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_COLOR)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'color': 3})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ColorID 3')

Esempio n. 5

File: test_representations.py Progetto: ziima/pyvmd

    def test_method(self):
        color = Color(self.rep)
        self.assertEqual(color.method, COLOR_NAME)

        color.method = COLOR_TYPE
        self.assertEqual(color.method, COLOR_TYPE)
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Type')

Esempio n. 6

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_pos_z(self):
     self.color.method = COLOR_POS_Z
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_POS_Z)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'PosZ')

Esempio n. 7

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_fragment(self):
     self.color.method = COLOR_FRAGMENT
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_FRAGMENT)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Fragment')

Esempio n. 8

 def test_pos_z(self):
     self.color.method = COLOR_POS_Z
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_POS_Z)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'PosZ')

Esempio n. 9

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_mass(self):
     self.color.method = COLOR_MASS
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_MASS)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Mass')

Esempio n. 10

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_restype(self):
     self.color.method = COLOR_RESTYPE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESTYPE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResType')

Esempio n. 11

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_conformation(self):
     self.color.method = COLOR_CONFORMATION
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CONFORMATION)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Conformation')

Esempio n. 12

 def test_physical_time(self):
     self.color.method = COLOR_PHYSICAL_TIME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_PHYSICAL_TIME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'PhysicalTime')

Esempio n. 13

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_velocity(self):
     self.color.method = COLOR_VELOCITY
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VELOCITY)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Velocity')

Esempio n. 14

 def test_backbone(self):
     self.color.method = COLOR_BACKBONE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_BACKBONE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Backbone')

Esempio n. 15

 def test_throb(self):
     self.color.method = COLOR_THROB
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_THROB)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Throb')

Esempio n. 16

 def test_index(self):
     self.color.method = COLOR_INDEX
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_INDEX)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Index')

Esempio n. 17

 def test_fragment(self):
     self.color.method = COLOR_FRAGMENT
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_FRAGMENT)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Fragment')

Esempio n. 18

 def test_user_4(self):
     self.color.method = COLOR_USER_4
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_USER_4)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'User4')

Esempio n. 19

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_backbone(self):
     self.color.method = COLOR_BACKBONE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_BACKBONE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Backbone')

Esempio n. 20

 def test_timestep(self):
     self.color.method = COLOR_TIMESTEP
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_TIMESTEP)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Timestep')

Esempio n. 21

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_physical_time(self):
     self.color.method = COLOR_PHYSICAL_TIME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_PHYSICAL_TIME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'PhysicalTime')

Esempio n. 22

 def test_velocity(self):
     self.color.method = COLOR_VELOCITY
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VELOCITY)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Velocity')

Esempio n. 23

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_element(self):
     self.color.method = COLOR_ELEMENT
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_ELEMENT)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Element')

Esempio n. 24

 def test_mass(self):
     self.color.method = COLOR_MASS
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_MASS)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Mass')

Esempio n. 25

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_chain(self):
     self.color.method = COLOR_CHAIN
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CHAIN)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Chain')

Esempio n. 26

 def test_element(self):
     self.color.method = COLOR_ELEMENT
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_ELEMENT)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Element')

Esempio n. 27

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_structure(self):
     self.color.method = COLOR_STRUCTURE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_STRUCTURE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Structure')

Esempio n. 28

 def test_resname(self):
     self.color.method = COLOR_RESNAME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESNAME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResName')

Esempio n. 29

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_occupancy(self):
     self.color.method = COLOR_OCCUPANCY
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_OCCUPANCY)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Occupancy')

Esempio n. 30

 def test_restype(self):
     self.color.method = COLOR_RESTYPE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESTYPE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResType')

Esempio n. 31

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_charge(self):
     self.color.method = COLOR_CHARGE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CHARGE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Charge')

Esempio n. 32

 def test_resid(self):
     self.color.method = COLOR_RESID
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESID)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResID')

Esempio n. 33

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_user_4(self):
     self.color.method = COLOR_USER_4
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_USER_4)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'User4')

Esempio n. 34

 def test_chain(self):
     self.color.method = COLOR_CHAIN
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CHAIN)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Chain')

Esempio n. 35

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_index(self):
     self.color.method = COLOR_INDEX
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_INDEX)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Index')

Esempio n. 36

 def test_segname(self):
     self.color.method = COLOR_SEGNAME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_SEGNAME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'SegName')

Esempio n. 37

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_throb(self):
     self.color.method = COLOR_THROB
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_THROB)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Throb')

Esempio n. 38

 def test_conformation(self):
     self.color.method = COLOR_CONFORMATION
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CONFORMATION)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Conformation')

Esempio n. 39

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_timestep(self):
     self.color.method = COLOR_TIMESTEP
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_TIMESTEP)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Timestep')

Esempio n. 40

 def test_molecule(self):
     self.color.method = COLOR_MOLECULE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_MOLECULE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Molecule')

Esempio n. 41

 def test_beta(self):
     self.color.method = COLOR_BETA
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_BETA)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Beta')

Esempio n. 42

 def test_structure(self):
     self.color.method = COLOR_STRUCTURE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_STRUCTURE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Structure')

Esempio n. 43

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_resname(self):
     self.color.method = COLOR_RESNAME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESNAME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResName')

Esempio n. 44

 def test_occupancy(self):
     self.color.method = COLOR_OCCUPANCY
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_OCCUPANCY)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Occupancy')

Esempio n. 45

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_resid(self):
     self.color.method = COLOR_RESID
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESID)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResID')

Esempio n. 46

File: representations.py Progetto: lumik/pyvmd

 def _get_method(self):
     raw_color = _molrep.get_color(self.representation.molecule.molid,
                                   self.representation.repindex)
     return _parse_raw_color(raw_color)[0]

Esempio n. 47

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_segname(self):
     self.color.method = COLOR_SEGNAME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_SEGNAME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'SegName')

Esempio n. 48

File: test_representations.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_set_parameters(self):
     color = Color(self.rep)
     color.method = COLOR_COLOR
     color.set_parameters(color=4)
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ColorID 4')
     self.assertEqual(color.get_parameters(), {'color': 4})

Esempio n. 49

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_molecule(self):
     self.color.method = COLOR_MOLECULE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_MOLECULE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Molecule')

Esempio n. 50

File: test_coloring_methods.py Progetto: ziima/pyvmd

 def test_beta(self):
     self.color.method = COLOR_BETA
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_BETA)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Beta')

Esempio n. 51

File: representations.py Progetto: ziima/pyvmd

 def _get_method(self):
     raw_color = _molrep.get_color(self.representation.molecule.molid, self.representation.repindex)
     return _parse_raw_color(raw_color)[0]

Esempio n. 52

 def test_charge(self):
     self.color.method = COLOR_CHARGE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CHARGE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Charge')

Esempio n. 53

File: representations.py Progetto: lumik/pyvmd

 def get_parameters(self):
     """Returns coloring parameters"""
     raw_color = _molrep.get_color(self.representation.molecule.molid,
                                   self.representation.repindex)
     return _parse_raw_color(raw_color)[1]

Esempio n. 54

File: representations.py Progetto: ziima/pyvmd

 def get_parameters(self):
     """Returns coloring parameters"""
     raw_color = _molrep.get_color(self.representation.molecule.molid, self.representation.repindex)
     return _parse_raw_color(raw_color)[1]