Python get_colorの例

コード例 #1

    def test_color(self):
        self.color.method = COLOR_COLOR
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_COLOR)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'color': 1})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ColorID 1')

        self.color.set_parameters(color=3)
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_COLOR)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'color': 3})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ColorID 3')

コード例 #2

    def test_volume(self):
        self.color.method = COLOR_VOLUME
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VOLUME)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'volume_id': 0})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Volume 0')

        self.color.set_parameters(volume_id=42)
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VOLUME)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'volume_id': 42})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Volume 42')

コード例 #3

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

    def test_volume(self):
        self.color.method = COLOR_VOLUME
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VOLUME)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'volume_id': 0})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Volume 0')

        self.color.set_parameters(volume_id=42)
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VOLUME)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'volume_id': 42})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Volume 42')

コード例 #4

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

    def test_color(self):
        self.color.method = COLOR_COLOR
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_COLOR)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'color': 1})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ColorID 1')

        self.color.set_parameters(color=3)
        self.assertEqual(self.color.method, COLOR_COLOR)
        self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {'color': 3})
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ColorID 3')

コード例 #5

ファイル: test_representations.py プロジェクト: ziima/pyvmd

    def test_method(self):
        color = Color(self.rep)
        self.assertEqual(color.method, COLOR_NAME)

        color.method = COLOR_TYPE
        self.assertEqual(color.method, COLOR_TYPE)
        self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Type')

コード例 #6

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_pos_z(self):
     self.color.method = COLOR_POS_Z
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_POS_Z)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'PosZ')

コード例 #7

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_fragment(self):
     self.color.method = COLOR_FRAGMENT
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_FRAGMENT)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Fragment')

コード例 #8

 def test_pos_z(self):
     self.color.method = COLOR_POS_Z
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_POS_Z)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'PosZ')

コード例 #9

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_mass(self):
     self.color.method = COLOR_MASS
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_MASS)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Mass')

コード例 #10

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_restype(self):
     self.color.method = COLOR_RESTYPE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESTYPE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResType')

コード例 #11

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_conformation(self):
     self.color.method = COLOR_CONFORMATION
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CONFORMATION)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Conformation')

コード例 #12

 def test_physical_time(self):
     self.color.method = COLOR_PHYSICAL_TIME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_PHYSICAL_TIME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'PhysicalTime')

コード例 #13

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_velocity(self):
     self.color.method = COLOR_VELOCITY
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VELOCITY)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Velocity')

コード例 #14

 def test_backbone(self):
     self.color.method = COLOR_BACKBONE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_BACKBONE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Backbone')

コード例 #15

 def test_throb(self):
     self.color.method = COLOR_THROB
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_THROB)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Throb')

コード例 #16

 def test_index(self):
     self.color.method = COLOR_INDEX
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_INDEX)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Index')

コード例 #17

 def test_fragment(self):
     self.color.method = COLOR_FRAGMENT
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_FRAGMENT)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Fragment')

コード例 #18

 def test_user_4(self):
     self.color.method = COLOR_USER_4
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_USER_4)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'User4')

コード例 #19

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_backbone(self):
     self.color.method = COLOR_BACKBONE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_BACKBONE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Backbone')

コード例 #20

 def test_timestep(self):
     self.color.method = COLOR_TIMESTEP
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_TIMESTEP)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Timestep')

コード例 #21

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_physical_time(self):
     self.color.method = COLOR_PHYSICAL_TIME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_PHYSICAL_TIME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'PhysicalTime')

コード例 #22

 def test_velocity(self):
     self.color.method = COLOR_VELOCITY
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_VELOCITY)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Velocity')

コード例 #23

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_element(self):
     self.color.method = COLOR_ELEMENT
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_ELEMENT)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Element')

コード例 #24

 def test_mass(self):
     self.color.method = COLOR_MASS
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_MASS)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Mass')

コード例 #25

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_chain(self):
     self.color.method = COLOR_CHAIN
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CHAIN)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Chain')

コード例 #26

 def test_element(self):
     self.color.method = COLOR_ELEMENT
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_ELEMENT)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Element')

コード例 #27

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_structure(self):
     self.color.method = COLOR_STRUCTURE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_STRUCTURE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Structure')

コード例 #28

 def test_resname(self):
     self.color.method = COLOR_RESNAME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESNAME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResName')

コード例 #29

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_occupancy(self):
     self.color.method = COLOR_OCCUPANCY
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_OCCUPANCY)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Occupancy')

コード例 #30

 def test_restype(self):
     self.color.method = COLOR_RESTYPE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESTYPE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResType')

コード例 #31

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_charge(self):
     self.color.method = COLOR_CHARGE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CHARGE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Charge')

コード例 #32

 def test_resid(self):
     self.color.method = COLOR_RESID
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESID)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResID')

コード例 #33

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_user_4(self):
     self.color.method = COLOR_USER_4
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_USER_4)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'User4')

コード例 #34

 def test_chain(self):
     self.color.method = COLOR_CHAIN
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CHAIN)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Chain')

コード例 #35

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_index(self):
     self.color.method = COLOR_INDEX
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_INDEX)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Index')

コード例 #36

 def test_segname(self):
     self.color.method = COLOR_SEGNAME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_SEGNAME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'SegName')

コード例 #37

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_throb(self):
     self.color.method = COLOR_THROB
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_THROB)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Throb')

コード例 #38

 def test_conformation(self):
     self.color.method = COLOR_CONFORMATION
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CONFORMATION)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Conformation')

コード例 #39

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_timestep(self):
     self.color.method = COLOR_TIMESTEP
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_TIMESTEP)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Timestep')

コード例 #40

 def test_molecule(self):
     self.color.method = COLOR_MOLECULE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_MOLECULE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Molecule')

コード例 #41

 def test_beta(self):
     self.color.method = COLOR_BETA
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_BETA)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Beta')

コード例 #42

 def test_structure(self):
     self.color.method = COLOR_STRUCTURE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_STRUCTURE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Structure')

コード例 #43

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_resname(self):
     self.color.method = COLOR_RESNAME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESNAME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResName')

コード例 #44

 def test_occupancy(self):
     self.color.method = COLOR_OCCUPANCY
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_OCCUPANCY)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Occupancy')

コード例 #45

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_resid(self):
     self.color.method = COLOR_RESID
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_RESID)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ResID')

コード例 #46

ファイル: representations.py プロジェクト: lumik/pyvmd

 def _get_method(self):
     raw_color = _molrep.get_color(self.representation.molecule.molid,
                                   self.representation.repindex)
     return _parse_raw_color(raw_color)[0]

コード例 #47

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_segname(self):
     self.color.method = COLOR_SEGNAME
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_SEGNAME)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'SegName')

コード例 #48

ファイル: test_representations.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_set_parameters(self):
     color = Color(self.rep)
     color.method = COLOR_COLOR
     color.set_parameters(color=4)
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'ColorID 4')
     self.assertEqual(color.get_parameters(), {'color': 4})

コード例 #49

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_molecule(self):
     self.color.method = COLOR_MOLECULE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_MOLECULE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Molecule')

コード例 #50

ファイル: test_coloring_methods.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def test_beta(self):
     self.color.method = COLOR_BETA
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_BETA)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Beta')

コード例 #51

ファイル: representations.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def _get_method(self):
     raw_color = _molrep.get_color(self.representation.molecule.molid, self.representation.repindex)
     return _parse_raw_color(raw_color)[0]

コード例 #52

 def test_charge(self):
     self.color.method = COLOR_CHARGE
     self.assertEqual(self.color.method, COLOR_CHARGE)
     self.assertEqual(self.color.get_parameters(), {})
     self.assertEqual(_molrep.get_color(self.molid, 0), 'Charge')

コード例 #53

ファイル: representations.py プロジェクト: lumik/pyvmd

 def get_parameters(self):
     """Returns coloring parameters"""
     raw_color = _molrep.get_color(self.representation.molecule.molid,
                                   self.representation.repindex)
     return _parse_raw_color(raw_color)[1]

コード例 #54

ファイル: representations.py プロジェクト: ziima/pyvmd

 def get_parameters(self):
     """Returns coloring parameters"""
     raw_color = _molrep.get_color(self.representation.molecule.molid, self.representation.repindex)
     return _parse_raw_color(raw_color)[1]