Python data_pathの例

コード例 #1

 def setUp(self):
     self.infile = data_path('test.sff')
     with open(data_path('test.raw')) as fp:
         self.expected = list(fp)[1:]

コード例 #2

ファイル: test_clean.py プロジェクト: fhcrc/ampliconnoise

 def setUp(self):
     self.fa_path = data_path("test.fa")
     self.dat_path = data_path("test.dat")
     self.raw_path = data_path("test.raw")

コード例 #3

ファイル: test_anoiseio.py プロジェクト: fhcrc/ampliconnoise

 def setUp(self):
     self.pnoise_fp = open(data_path('test-pnoise.mapping'))
     self.snoise_fp = open(data_path('test-snoise.mapping'))

コード例 #4

ファイル: test_clean.py プロジェクト: fhcrc/ampliconnoise

 def setUp(self):
     self.fa_path = data_path('test.fa')
     self.dat_path = data_path('test.dat')
     self.raw_path = data_path('test.raw')

コード例 #5

ファイル: test_pyronoise.py プロジェクト: fhcrc/ampliconnoise

 def setUp(self):
     self.sff_path = data_path('test.sff')
     self.expected_path = data_path('test-pnoise_cd.fa',)
     self.mapping_path = data_path('test-pnoise.mapping')
     with open(self.expected_path) as fp:
         self.expected = list(fp)

コード例 #6

ファイル: test_sff2raw.py プロジェクト: fhcrc/ampliconnoise

 def setUp(self):
     self.infile = data_path('test.sff')
     with open(data_path('test.raw')) as fp:
         self.expected = list(fp)[1:]

コード例 #7

ファイル: test_anoiseio.py プロジェクト: fhcrc/ampliconnoise

 def setUp(self):
     self.pnoise_fp = open(data_path('test-pnoise.mapping'))
     self.snoise_fp = open(data_path('test-snoise.mapping'))