Exemplos de nonzero_neurite_radii em Python

Exemplo n.º 1

Arquivo: test_morphology.py Projeto: Tsolmongerel/NeuroM

def test_nonzero_neurite_radii_threshold():
    nrn = NEURONS['Neuron.swc']

    ids = check_morph.nonzero_neurite_radii(nrn)
    nt.ok_(len(ids) == 0)

    ids = check_morph.nonzero_neurite_radii(nrn, threshold=0.25)
    nt.assert_equal(len(ids), 118)

Exemplo n.º 2

def test_nonzero_neurite_radii_threshold():
    nrn = NEURONS['Neuron.swc']

    ids = check.nonzero_neurite_radii(nrn)
    nt.ok_(len(ids) == 0)

    ids = check.nonzero_neurite_radii(nrn, threshold=0.25)
    nt.assert_equal(len(ids), 118)

Exemplo n.º 3

Arquivo: test_morphology.py Projeto: Tsolmongerel/NeuroM

def test_nonzero_neurite_radii_good_data():
    files = ['Neuron.swc',
             'Single_apical.swc',
             'Single_basal.swc',
             'Single_axon.swc',
             'Neuron_2_branch.h5',
             ]

    for n in _pick(files):
        ids = check_morph.nonzero_neurite_radii(n)
        nt.ok_(len(ids) == 0)

Exemplo n.º 4

def test_nonzero_neurite_radii_good_data():
    files = [
        'Neuron.swc',
        'Single_apical.swc',
        'Single_basal.swc',
        'Single_axon.swc',
        'Neuron_2_branch.h5',
    ]

    for n in _pick(files):
        ids = check.nonzero_neurite_radii(n)
        nt.ok_(len(ids) == 0)

Exemplo n.º 5

Arquivo: test_morphology.py Projeto: Tsolmongerel/NeuroM

def test_nonzero_neurite_radii_bad_data():
    nrn = NEURONS['Neuron_zero_radius.swc']
    ids = check_morph.nonzero_neurite_radii(nrn)
    nt.ok_(ids == [194, 210, 246, 304, 493])

Exemplo n.º 6

def test_nonzero_neurite_radii_bad_data():
    nrn = NEURONS['Neuron_zero_radius.swc']
    ids = check.nonzero_neurite_radii(nrn)
    nt.ok_(ids == [194, 210, 246, 304, 493])