Beispiel #1
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'script_recover_fragments')
Beispiel #2
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'cutadapt_pe')
Beispiel #3
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'picard_MarkDuplicates')
Beispiel #4
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'IGVTools')
Beispiel #5
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'MACS2')
Beispiel #6
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'bedtools')
Beispiel #7
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'samtools_flagstat')
Beispiel #8
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'FSeq')
Beispiel #9
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'samtools_view')
Beispiel #10
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'bwa_sampe')
Beispiel #11
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'bwa_aln')
Beispiel #12
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'fastqc')
Beispiel #13
0
 def __init__(self, name):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, name)