Esempio n. 1
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'script_recover_fragments')
Esempio n. 2
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'cutadapt_pe')
Esempio n. 3
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'picard_MarkDuplicates')
Esempio n. 4
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'IGVTools')
Esempio n. 5
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'MACS2')
Esempio n. 6
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'bedtools')
Esempio n. 7
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'samtools_flagstat')
Esempio n. 8
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'FSeq')
Esempio n. 9
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'samtools_view')
Esempio n. 10
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'bwa_sampe')
Esempio n. 11
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'bwa_aln')
Esempio n. 12
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'fastqc')
Esempio n. 13
0
 def __init__(self, name):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, name)