Ejemplo n.º 1
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'script_recover_fragments')
Ejemplo n.º 2
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'cutadapt_pe')
Ejemplo n.º 3
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'picard_MarkDuplicates')
Ejemplo n.º 4
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'IGVTools')
Ejemplo n.º 5
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'MACS2')
Ejemplo n.º 6
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'bedtools')
Ejemplo n.º 7
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'samtools_flagstat')
Ejemplo n.º 8
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'FSeq')
Ejemplo n.º 9
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'samtools_view')
Ejemplo n.º 10
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'bwa_sampe')
Ejemplo n.º 11
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'bwa_aln')
Ejemplo n.º 12
0
 def __init__(self):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, 'fastqc')
Ejemplo n.º 13
0
 def __init__(self, name):
     PipelineSoftwareBase.__init__(self, name)