Python benchmark_fish_scrna Beispiele

Programmiersprache: Python

Namespace / Paketname: scvi.benchmark

Methode / Funktion: benchmark_fish_scrna

Beispiele auf hotexamples.com: 2

Python benchmark_fish_scrna - 2 Beispiele gefunden. Dies sind die am besten bewerteten Python Beispiele für die scvi.benchmark.benchmark_fish_scrna, die aus Open Source-Projekten extrahiert wurden. Sie können Beispiele bewerten, um die Qualität der Beispiele zu verbessern.

Beispiel #1

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def test_fish_rna(save_path):
    gene_dataset_fish = SmfishDataset(save_path)
    gene_dataset_seq = CortexDataset(save_path=save_path,
                                     genes_fish=gene_dataset_fish.gene_names,
                                     genes_to_keep=[],
                                     additional_genes=50)
    benchmark_fish_scrna(gene_dataset_seq, gene_dataset_fish)

Beispiel #2

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Datei: test_scvi.py Projekt: yunchen-yang/scVI

def test_fish_rna(save_path):
    gene_dataset_fish = SmfishDataset(save_path)
    gene_dataset_seq = CortexDataset(
        save_path=save_path,
        genes_to_keep=gene_dataset_fish.gene_names,
        total_genes=gene_dataset_fish.nb_genes + 50)
    benchmark_fish_scrna(gene_dataset_seq, gene_dataset_fish)