Ejemplos de benchmark_fish_scrna en Python

Lenguaje de programación: Python

Namespace/Package Name: scvi.benchmark

Método / Función: benchmark_fish_scrna

Ejemplos en hotexamples.com: 2

Python benchmark_fish_scrna - 2 ejemplos encontrados. Estos son los ejemplos en Python del mundo real mejor valorados de scvi.benchmark.benchmark_fish_scrna extraídos de proyectos de código abierto. Puedes valorar ejemplos para ayudarnos a mejorar la calidad de los ejemplos.

Ejemplo n.º 1

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def test_fish_rna(save_path):
    gene_dataset_fish = SmfishDataset(save_path)
    gene_dataset_seq = CortexDataset(save_path=save_path,
                                     genes_fish=gene_dataset_fish.gene_names,
                                     genes_to_keep=[],
                                     additional_genes=50)
    benchmark_fish_scrna(gene_dataset_seq, gene_dataset_fish)

Ejemplo n.º 2

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Archivo: test_scvi.py Proyecto: yunchen-yang/scVI

def test_fish_rna(save_path):
    gene_dataset_fish = SmfishDataset(save_path)
    gene_dataset_seq = CortexDataset(
        save_path=save_path,
        genes_to_keep=gene_dataset_fish.gene_names,
        total_genes=gene_dataset_fish.nb_genes + 50)
    benchmark_fish_scrna(gene_dataset_seq, gene_dataset_fish)