Esempi in Python per benchmark_fish_scrna

Linguaggio di programmazione: Python

Spazio dei nomi/nome del pacchetto: scvi.benchmark

Metodo/funzione: benchmark_fish_scrna

Esempi su hotexamples.com: 2

benchmark_fish_scrna in Python: 2 esempi trovati. Questi sono i migliori esempi reali in Python per scvi.benchmark.benchmark_fish_scrna, estratti da progetti open source. Li puoi valutare, per aiutarci a migliorare la qualità dei nostri esempi.

Esempio n. 1

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def test_fish_rna(save_path):
    gene_dataset_fish = SmfishDataset(save_path)
    gene_dataset_seq = CortexDataset(save_path=save_path,
                                     genes_fish=gene_dataset_fish.gene_names,
                                     genes_to_keep=[],
                                     additional_genes=50)
    benchmark_fish_scrna(gene_dataset_seq, gene_dataset_fish)

Esempio n. 2

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File: test_scvi.py Progetto: yunchen-yang/scVI

def test_fish_rna(save_path):
    gene_dataset_fish = SmfishDataset(save_path)
    gene_dataset_seq = CortexDataset(
        save_path=save_path,
        genes_to_keep=gene_dataset_fish.gene_names,
        total_genes=gene_dataset_fish.nb_genes + 50)
    benchmark_fish_scrna(gene_dataset_seq, gene_dataset_fish)