Ejemplos de min_ungap_length_discard en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_transform.py Proyecto: pansapiens/seqmagick

 def test_partial(self):
     result = transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 4)
     self.assertEqual([self.sequences[1], self.sequences[3]], list(result))

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_transform.py Proyecto: pansapiens/seqmagick

 def test_none_pass(self):
     result = list(transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 8))
     self.assertEqual([], result)

Ejemplo n.º 3

Archivo: test_transform.py Proyecto: pansapiens/seqmagick

 def test_all_pass(self):
     result = list(transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 0))
     self.assertEqual(self.sequences, result)

Ejemplo n.º 4

Archivo: test_transform.py Proyecto: yimsea/seqmagick

 def test_partial(self):
     result = transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 4)
     self.assertEqual([self.sequences[1], self.sequences[3]], list(result))

Ejemplo n.º 5

Archivo: test_transform.py Proyecto: yimsea/seqmagick

 def test_all_pass(self):
     result = list(transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 0))
     self.assertEqual(self.sequences, result)

Ejemplo n.º 6

Archivo: test_transform.py Proyecto: yimsea/seqmagick

 def test_none_pass(self):
     result = list(transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 8))
     self.assertEqual([], result)

Ejemplo n.º 7

Archivo: test_transform.py Proyecto: fhcrc/seqmagick

 def test_partial(self):
     result = transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 4)
     self.assertEqual(
         [self.sequences[1].seq, self.sequences[3].seq],
         [seq.seq for seq in result])

Ejemplo n.º 8

Archivo: test_transform.py Proyecto: peterjc/seqmagick

 def test_partial(self):
     result = transform.min_ungap_length_discard(self.sequences, 4)
     self.assertEqual([self.sequences[1].seq, self.sequences[3].seq],
                      [seq.seq for seq in result])