Esempio n. 1
0
class SimpleGzipInfoTestCase(InfoMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta.gz')
Esempio n. 2
0
class SimpleBzip2InfoTestCase(InfoMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta.bz2')
Esempio n. 3
0
class MultithreadedInfoTestCase(InfoMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta')
    threads = 2
Esempio n. 4
0
class GzipExtractIdsTestCase(ExtractIdsMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta.gz')
Esempio n. 5
0
class Bz2ExtractIdsTestCase(ExtractIdsMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta.bz2')
Esempio n. 6
0
class SimpleExtractIdsTestCase(ExtractIdsMixin, unittest.TestCase):
    seq_file = data_path('input2.fasta')
Esempio n. 7
0
class MogrifyGzipInputTestCase(CommandLineTestMixIn,
                               test_convert.GzipInputConvertTestCase):
    command = 'mogrify {input}'
    expected_path = data_path('output2.fasta')
    out_suffix = 'fasta.gz'